Chính Lam kỳ được phân thành 3 bộ phận: Mãn Châu, Mông Cổ và Hán quân. Ban đầu, Kỳ chủ của Chính Lam kỳ chính là Mãng Cổ Nhĩ Thái - một trong Tứ đại Bối lặc là đảm nhiệm.

Năm Thiên Thông thứ 6 (1632), Mãng Cổ Nhĩ Thái bị hoạch tội cách chức, Chính Lam kỳ liền do Đại hãn Hoàng Thái Cực đích thân thống soái, trở thành một trong Thượng Tam kỳ.

Thẳng đến khi Thuận Trị kế vị, Duệ Thân vương Đa Nhĩ Cổn nhiếp chính, ông liền đem Chính Bạch kỳ do mình quản lý chuyển lên Thượng Tam kỳ, còn Chính Lam kỳ chuyển xuống Hạ Ngũ kỳ. Đa Nhĩ Cổn giao vị trí Kỳ chủ Chính Lam kỳ cho em trai là Đa Đạc. Đa Đạc làm Kỳ chủ được 1 năm thì qua đời, do con trai là Đa Ni thừa kế vị trí Kỳ chủ.